در حالی که آیت‌الله هاشمی رفسنجانی می‌گوید در دوران جنگ جلوی اعدام یکی از فرماندهان را گرفته، رئیس سازمان قضایی نیروهای مسلح در ایام جنگ با رد تمامی شایعه‌ها در خصوص حکم اعدام برخی فرماندهان عالی‌رتبه در آن دوران اظهار داشت: موضوع خیانت فرماندهان به هیچ عنوان مطرح نبود و امام هیچ‌وقت نگفتند فرماندهان خائن هستند.
وقتی پزشکان برای معالجه هاشمی‌رفسنجانی به صف شدند با ناراحتی چشم و خارش صورت در جلسه ستاد مبارزه با مواد مخدر شرکت کردم، دو سه ساعت با ناراحتی در جلسه بودم و دیگر نتوانستم به کار ادامه دهم.
